Curso-taller “Introducción al modelado de proteínas” (virtual)

FECHA: Del 21 de octubre al 3 de noviembre del 2024

INSCRIPCIONES: Ya seas peruano o extranjero, realiza el pago y adjunta el voucher dentro de la ficha de inscripción disponible en https://forms.gle/qLRBwsaDSqN9oL2y7 o puedes mandar el voucher junto a tu nombre completo y tu correo de gmail a nuestro WhatsApp (aquí). Un día antes del curso (domingo a las 8pm de Perú) recibirás la contraseña e indicaciones de acceso al aula. Cualquier consulta también puedes escribir a nuestro correo instituto.genetica.igbm@gmail.com

PAGO: Realiza el pago y adjunta el voucher en la ficha de inscripción correspondiente al curso.

  • Peruanos -> Transfiere 120 soles al Banco Scotiabank Número de cuenta: 052-7343735 CCI: 00905520052734373557 Yape o PLIN (cel.): 966158796 Titular: Michelle Chirinos o al banco Interbank Número de cuenta: 2003006292400 CCI: 00320000300629240033 a nombre del Instituto de Genética Barbara McClintock.

  • Extranjeros -> Transfiere 40 USD por PayPal: https://www.paypal.com/paypalme/capacitacionIGBM/40 o por medio de Western Union: 40 USD + comisión Western. Beneficiario Michelle Chirinos Arias, DNI 44337272, dirección Lima (Perú). Inscríbete hasta el 21 de octubre.

SOBRE EL CURSO: En este curso aprenderás de bioinformática estructural, métodos de modelamiento de proteínas, predicción de estructuras secundarias, modelado y refinamiento de proteínas, qué es AlphaFold, aplicaciones del modelado de proteínas, desafíos y limitaciones del modelado, ejemplos y caso de estudio. Además, tendrás 3 talleres para caracterizar, alinear y modelar proteínas.

HORARIO: Modalidad virtual, se adapta al horario del alumno. Las clases se encuentran grabadas en videos, por lo que, el alumno puede ver los videos en la plataforma, en el momento que pueda y las veces que considere necesarias (durante la duración del curso). Además, contamos con un foro de consultas, donde el alumno puede escribir su consulta, adjuntar capturas de pantalla, PDFs, videos, audios y el profesor las resolverá.

HORAS: 40 horas cronológicas

CERTIFICADO: A nombre del Instituto de Genética Barbara McClintock, institución legalmente constituida en el Perú (verificar Ficha RUC 20600623801). El certificado se entrega vía online protegido de edición, con número de registro y disponible en nuestra base de datos para verificación. Para adquirirlo se tomará un examen básico que debe aprobar. El examen se puede rendir hasta el último día del curso.

Dinámica de estudio

  • Un día antes del inicio del curso (domingo en la noche): Se entrega la contraseña e indicaciones detalladas de cómo usar el aula virtual a su correo.

  • Del primer al último día del curso: Puede acceder en el horario que más le convenga a los videos de las clases, a las diapositivas y al material extra. El acceso al curso y material solo será en LAS FECHAS INDICADAS (14 días).

  • Del primer al último día del curso: Puede consultar a cualquier hora en el foro las dudas con el ponente.

  • Último día del curso: A las 11:59pm vence el plazo máximo para resolver y aprobar el examen y así recibir el certificado. Las calificaciones son personales. Si tiene al menos 11/20 se le entregará el certificado en el cual solo figurará que “asistió y aprobó” el curso pero no figurará la nota. Puedes dar el examen hasta en 3 oportunidades y revisar tus apuntes porque el objetivo es reforzar lo aprendido.

  • Cuatro días luego de finalizado el curso: Se entregará el certificado registrado y numerado por el Instituto de Genética Barbara McClintock, vía online y protegido de edición. Recuerde que nuestros certificados al estar numerados y registrados, su empleador o asesor podrá consultar si realmente llevó el curso y recibirá un correo de nosotros.
    Una vez terminado el curso, el estudiante tiene acceso un mes más al material de la clase pero no al examen, ni al foro.

Programa:

Clase 1: Introducción a la Bioinformática estructural

Conceptos básicos, estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria de las proteínas, biología estructural, importancia de estudiar proteínas y sus interacciones, tipos de interacciones proteína-proteína y proteína-ligando. Determinación de los parámetros bioquímicos.

Taller 1: Caracterización in silico de una proteína.

Clase 2: Métodos de modelamiento de proteínas

Modelado por homología, modelado de estructura ab initio, modelado por threading (predicción de la estructura). Cuando usar cada uno.

Clase 3: Bases de datos biológicas para el estudio de proteínas

NCBI + Expasy, BLAST, Uniprot, PDB, PDBsum, STRING-DB, etc.

Clase 4: Predicción de estructuras secundarias de proteínas

Alineamiento de secuencias aminoacídicas, visualización de proteínas en PyMol, editando PDBs, predicción de estructuras secundarias, modelamiento tridimensional, validación de estructuras tridimensionales

Taller 2: Alineamiento múltiple de secuencias aminoacídicas y filogenia con proteínas

Clase 5: Modelado de proteínas y refinamiento

Swiss Model, Phyre2, Robetta y visualización en PyMol. ModRefiner, ProFunc, ProSA-web. Cómo funciona el modelo de cadenas ocultas de Markov.

Taller 3: Pipeline para modelado y validación del modelo tridimensional de la proteína

Clase 6: AlphaFold

¿Qué es y cómo funciona AlphaFold- ColabFold? Predicción de estructuras proteicas.

Clase 7: Aplicaciones del modelamiento de proteínas

Identificación de sitios de unión de ligandos, diseño de fármacos, estudios de interacciones proteína-proteína y proteína-ligando, etc.

Clase 8: Desafíos y limitaciones del modelamiento de proteínas

Precisión y fiabilidad de los modelos, validación de los modelos, integración de datos experimentales y de modelado.

Clase 9: Ejemplos y casos de estudio

Modelado de proteínas de interés biológico de una familia involucrada en la reparación de ADN. Análisis de interactoma y predicción de posibles funciones adicionales.

Docente: Michelle Chirinos Arias, Ph.D.

CEO y fundadora del Instituto de Genética Barbara McClintock-IGBM, ForkyBiolab (biomateriales), Científico Inversionista y 3Dna Impresionesin. Además, directora de bioemprendimiento e inversiones en Biohubventure. Doctora en Ciencias Biológicas; con una maestría en Ciencia, Tecnología y Sociedad (CTS); un posgrado de especialización en Bioinformática; otro posgrado en Biología Molecular y citogenética humana, bióloga-biotecnóloga; experta en programación; técnica en robótica y en enfermería y actualmente realiza una maestría en docencia universitaria. Sus áreas actuales de investigación incluyen la genética molecular, la bioinformática y el área CTS donde investiga la Comunicación Pública de la Ciencia. Cuenta con amplia experiencia en investigación en el área de genética y biología molecular tanto de microorganismos, plantas y humanos (desde el 2007 a la actualidad). Calificada como investigadora CONCYTEC, posee publicaciones en revistas indexadas a Web of Science, Scopus y Scielo, es revisora de revistas científicas de Chile y Polonia, ponente nacional e internacional (más de 50 conferencias). Es divulgadora científica, directora de la revista de divulgación del IGBM, ha escrito cuentos y manuales infantiles para la difusión de la genética que se han traducido al quechua, ha participado en colaboración con la Arizona State University y es voluntaria de su programa Ask A Biologist. Realiza asesorías en investigación en el área de biología molecular por medio del IGBM y en el área de finanzas, inversiones y en la formación de emprendimientos de base STEM por medio de Científico inversionista.

En cuanto al área de bioinformática, la Dra. Michelle Chirinos tiene un posgrado de especialización en bioinformática en cuya tesis desarrolló una base de datos y tres herramientas bioinformáticas. Además, de ser experta en programación, en uno de los capítulos de su tesis doctoral desarrolló un análisis in silico, en cual modela una familia de proteínas, realizó un análisis de interacción proteína-proteína y docking molecular descubriendo que nuevas funciones para este familia de proteínas, mientras que en otro capítulo de su tesis doctoral, refuerza con experimentos de citometría de flujo, los hallazgos encontrados in silico. Finalmente, actualmente realiza una tesis desarrollando una metodología para la enseñanza de la bioinformática.

Tesis realizadas: 1) Rol del sistema de reparación de apareamientos incorrectos (MMR) en el ADN en la respuesta de las plantas al estrés (defensa Summa cum laude), 2) EURECA (Eukaryote DNA Capacity), una plataforma web con una base de datos para el estudio de los sistemas de reparación indirecta del ADN en eucariotas y con herramientas bioinformáticas (defensa Summa cum laude), 3) Análisis de la variabilidad genética entre 30 accesiones de tarwi usando ISSRs y microsatélites, 4) CAPTA: nuevos desafíos en comunicación pública de las ciencias biológicas en Lima en contextos de COVID-19, 5) Desarrollo de una metodología para la enseñanza de la bioinformática a alumnos de las carreras de ciencias biológicas (en curso), 6) Formulación de un diseño instruccional para la formación de bioemprendedores.

Formación Académica:

-Doctorado en Ciencias Biológicas (UNR, Argentina)

-Maestría en Ciencia, Tecnología y Sociedad (UNQ, Argentina)

-Maestría en Docencia con mención en educación superior (USMP, Perú)

-Postgrado de Especialización en Bioinformática (UNR, Argentina)

-Postgrado en Biología Molecular y Citogenética Humana (Perú)

-Título de Bióloga/Biotecnóloga (UNALM, Perú)

-Bachiller en Ciencias-Biología (UNALM, Perú)

-Profesora de emprendimiento e innovación (USAL, España)

-Experta Universitaria en Programación (Argentina)

-Técnica en Robótica (Argentina)

-Técnica Auxiliar de enfermería (Argentina)

Descuentos y facilidades de pago

>Descuentos por inscripción temprana

20% de descuento (pagas 96 soles o 32 USD) si te inscribes hasta el 30 de septiembre.

>Descuentos para ex-alumnos

10% de descuento (pagas 108 soles o 36 USD) si ya llevaste un curso o taller con nosotros. En la ficha inscripción verás un ítem donde tendrás que colocar el número de registro de alguno de los certificados que recibiste y adjuntar el voucher con tu descuento. Nosotros lo verificaremos con la base de datos.

> Descuentos corporativos

3 personas: 90 soles o  30 USD c/u (25% de descuento c/u).

4 personas: 84 soles o 28 USD c/u (30% de descuento c/u).

En este caso la inscripción se realiza por el correo instituto.genetica.igbm@gmail.com ya NO por el formulario de inscripción y se adjunta en un solo mensaje el monto completo por el pago de todos los inscritos, ya que solo así aplicará el descuento.

>Pago en 2 cuotas

Paga el 50% hasta el inicio del curso (manda un correo con tu nombre y voucher a instituto.genetica.igbm@gmail.com con el asunto "pago en dos cuotas [nombre del curso]"- El otro 50% puedes pagarlo el último día del curso. Solo se entregará el certificado a los que realizaron el pago completo.

>Media beca

Este curso cuenta con la posibilidad de ganar una media beca. Para ello debes ser ex-alumno del IGBM, estudiante de pregrado (peruano o extranjero), tener buenas calificaciones y presentar las razones de por qué debemos darte la media beca. Encuentra los requisitos aquí

10 Medias becas disponibles.

Ningún descuento es acumulable, ni transferible a alguna otra persona.

Si estás en el extranjero puedes realizar directamente el pago por aquí. Solo coloca el precio del curso. Si aplicas a algún descuento por inscripción temprana, corporativo o por ex-alumno, coloca el precio con descuento y realiza el pago. Luego adjunta ese voucher a instituto.genetica.igbm@gmail.com o súbelo a la ficha de inscripción correspondiente.

Ventajas de los cursos del IGBM

Certificación

Al finalizar el curso recibirás un certificado de asistencia y aprobación.

¿Tienes preguntas sobre nuestros cursos

woman in black long sleeve shirt and gray pants standing on brown grass field during daytime
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El curso me ayudó mucho, yo tenía conocimientos muy básicos sobre este tema por la universidad pero con este curso (muy didáctico por cierto) aprendí mucho más. Gracias y felicitaciones.

Testimonios

woman in white blue and green floral shirt
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Gracias por el curso, gracias Michelle por enseñarnos de tan bonita manera. Desde El Salvador.

man crossing both arms
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Muchas gracias por el curso. Estuvo bien explicado y fue bien entendible. Gracias por compartir información. Saludos desde Chile.

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